「科学」和「异端科学」的区别，用例子来讲的话应该更容易理解。
就相当于御坂美琴和木原的区别。
处于科学环境下成长的御坂美琴，并不相信魔法还有神明等存在，即使神话中的巨龙和她战斗，她也只会通过科学的思维去理解和解释。
这种情况下的御坂美琴并不会走向极端，也不会为了科学去认同人体实验这种事，但是处于「异端科学」下的木原会。
而且还有一个区别就是，御坂美琴是在科学这种原型的框架下自然成长的，木原是用「原型制御」的手段强行改变的。
对此，案例为木原圆周，这个女孩在幼年时被关在了黑暗的牢笼中，那时的她连小学知识都没有，也就没有什么科学与非科学的概念，但是依然使用了科学的思考模式。
御坂美琴是因为在科学环境下成长才会有这种价值认同，但没有在科学环境的影响下的木原圆周，也受到了类似的效果，但是这个效果要比正常环境下形成的原型思维要更加牢固。
御坂美琴只是习惯了科学世界，如果要她相信魔法会带来世界观的更新，这种原型并不是「原型制御」，所以是可以通过自身了解来改变的。
木原则是无法改变，只能继续被「异端科学」限制住原型。
当然，受到这种制约并不代表着全盘否定非科学的事物。
就例如木原加群会加入格雷姆林学习魔法一样，还有木原数多会在看到保险丝·风斩羽翼的情况下，会思考非科学法则的存在，以及木原脑干承认魔法存在的事实。
以上是原型的原理，关于「原型制御」实际控制木原的方法，则是亚雷斯塔噩梦一般的杰出成果。
首先关于「原型制御」是科学还是魔法手段尚不知晓，即便木原天川是亲身的经历者，也没有发现这到底是科学技术还是魔法术式。
但可以确定的是，这种手段是「幻想杀手」无法消除的。
亚雷斯塔可以随意创造和毁灭原型，也就意味着，如果有一天木原会对自己进行反叛，他也可以随时毁灭「异端科学」这个原型。
那么以这个原型为依据的木原一族，就会彻底变成废品，变成没有牙齿和利爪的猫。
原型制御的微妙之处正在于亚雷斯塔可以以个人的好恶将人们归类于不同的分类让对他们对立：东南西北、善良与邪恶，然后把握住定义将其中一方彻底破坏。
木原脑干认为，亚雷斯塔有朝一日甚至可以通过自己掌握的近代西洋魔法的原型，广推至魔法侧的领域，最终毁掉一切魔法。
其次，使用「原型制御」的手段也可以改变一个人的想法。
还是以木原圆周为例，她被关在黑暗房间的时候，其实是改变了她的想法，让她以为关进房间是自己的意愿，自己想要被关进房间才会出现在这里。
这种用途也被用于木原天川的身上。
亚雷斯塔因为做什么事都会失败的诅咒无法直接利用天川大脑中关于未来的记忆行动，所以用「原型制御」的这种用途让木原天川认为，是她自己想要帮助亚雷斯塔完成计划，并以此为行动。
即使天川知道自己的行为是受到了影响才这么想，但依然会按照亚雷斯塔改变的想法行事。
三、关于原型制御的解决方案。
在原着中，原型制御至少有两种解决方案。
第一种是由木原唯一想到的方法。
在她看来，「原型制御」这种东西说到底是为了将人划分才会出现的东西，只能控制少数派而无法控制全部。
那只要将全世界六十亿人都变成木原，就不存在少数派，也就不会有划分人类类别这种方式了，自然就会脱离亚雷斯塔的掌控。
但这个方法对天川来说太不现实了，如果能做到这一点，那么首先要解决魔法这一个原型吧。
所以这个方案第一时间被天川否定了。
第二个方法是从土御门元春的身上获取的方法，那就是赋予自己两个原型，即二重身份。
作为划分价值认同和人类类别的武器，亚雷斯塔只能同时使用一种原型来进行制御。
但如果这个人在制御之前就有两种类别呢？
土御门是「必要之恶教会」的魔法师，为了卧底来到学园都市，但是仅仅36小时就暴露了，最后只能成为多面间谍，同时拥有魔法和科学两种认同。
之前提到过，即使身处于科学的木原也会在看到魔法后承认其存在，那么普通人在被两种原型划分之前就接受了两种原型，就会像土御门元春一样，同时拥有科学侧和魔法侧两种身份。
也就是说，无论亚雷斯塔想让土御门倾向于能力者还是魔法师，土御门都会用自己另一边的身份来脱离「原型制御」的掌控。
这个也是目前是最有效的办法，也是天川的第二方案，获得一份魔法侧的原型。
之所以是第二方案是因为她在学园都市，在科学侧的大本营，很难取得魔法侧的身份。
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