听了明三秋的解释，沈飞等人才明白，天元阁看着唬人，其实里面的精华不多。不知名的个人作者里有埋没的天才，更多的却是一些见识不多自视甚高者的自说自话。有些书天机宫也清楚价值不大，纯粹就是保存而已，如果不是知情者明三秋说明，他们可能真要浪费不少时间。
取过总目录大致浏览了一下，易学、算经、天文藏书各占三分之一，易学中有三成是占卜的，其他书中也有大量占卜内容，纯粹从儒学、道家、数学、医学、兵法角度解读《易》经不到三成，水平较高的也就一成。
历代知名算经里根本不必看，太学里经过一年的整理他们太熟悉了，只是在明三秋的介绍下注意了那些没有听说过的数学著作，这些才是有价值的，是不知名的高水平数学家的私人笔记，作者多数是天机宫历代先祖。
四十五卷《天机笔记》基本都是这种内容，大部分是对古今知名算经的注解和学习过程，还有关于垛积术、天元术、四元术等数学方法的应用心得，有些还真能给秦九韶等人一些启发，郭守敬则是翻了一下天文著作，轻轻摇头，这些书的水平已经不如他了。
几人迅速整理了目录，确定了需要刻印书目的优先等级批次，就去了下一站：存放机械设计图纸和模型的灵台。这里原本是明归主管的，不过现在明归已废，有秦伯符和明三秋在，自然畅通无阻。里面有见过的木牛流马、天机三轮，还有基于原先认识的天体运行、指南车、地动仪、水运仪象台，最扎眼的是还有一些武器，各种战船、抛石机、弩炮的模型。
对天文仪器最敏感的郭守敬忍不住感叹：“天机宫真是人才济济啊，听闻这水运仪象台是苏魏公所制，毁于靖康之难，南渡后君臣找苏魏公的助手想再造一台，却再也造不出来，没想到他们倒是复原成功了”。
秦九韶冷哼了一声，说：“水运仪象台和外面那个天机三轮原理相似，能制作出天机三轮，造得出水运仪象台不算希奇。他们的胆子可不少，居然有这么多武器，幸好只是模型，否则光凭这些东西，就够给他们安几条死罪”。秦九韶参与过几件武器的设计研发，对这方面相当敏感。
沈飞说：“所有武器模型和图纸全部收剿，参加过研发的人员强制收编进军器监，从护卫中分出五十个人把他们先押回去，三秋，你知道是哪些人吗”？
明三秋说：“我知道，连我叔叔，一共是八个人，全带走吗”？
沈飞略一思索，说：“明归就留在这里吧，和花宫主说清楚，今后别让他出天机宫，还有今后天机宫里或者禁止研发武器，或者受军器监管理，让她自己选吧”，董海川领命而去。
又和天元阁一样整理出分级书目到了别处，去了药王亭、九州园搜集了医药和民生、地理博物学著作就告一段落了，这次除了威慑天机宫，只是来整理书目的，真刻书要大量的工匠，是长期工作。至于佛经道藏、辞章经史，天机宫绝没有自己几个世界积累的多，还可以请些“专业”人员来整理。
之后沈飞在天机宫留在三天，这期间明三秋找了十几个对数学有浓厚兴趣的学生，向秦九韶学了阿拉伯数字符号体系，花清渊和韩凝紫也顺势办了婚礼，花清渊有公羊羽支持，韩凝紫有沈飞支持，花无媸不满也没用。
在婚宴沈飞给了夫妻俩一人一瓶五宝花蜜酒作为礼品，暗中也给了秦伯符一瓶，他的功力也踏入了绝顶高手，还解决了毒抗这最后的短板。至于公羊羽，他还要等几天，要在出家后才享用“福星第八子”的待遇，明三秋则要到进太学之后。
灵台确定不再研发军事武器，作为补偿沈飞答应把发明的各种农业机械和图纸给了天机宫。这三天里其他天机几鹤也陆续来拜访，流露出投靠朝廷的意思，沈飞未置可否，只是称赞了他们几句，几鹤随后就去巴结秦伯符了，他们都不傻，能看得出以后秦伯符就是朝廷在天机宫里的代理人了，是比宫主还粗的大腿。
之后沈飞一行人正式离开了，一起走的还有公羊羽、新婚的花清渊韩凝紫夫妇、明三秋和他的十几个数学同好，还花了一大笔钱，赎走了二十几个有相当文化基础的丫鬟。沈飞早就有在打算在太学中招收女生，开放女性官吏的念头，先前人员不足，现在可以开始了，一年下来尚书内省培养了两百多个有文化和政务经验的宫女，选出几个放在太学当教师，教出一批人来就可以任命到外庭。
花无媸抱怨沈飞挖天机宫的人确实狠了一些，沈飞承诺这些人学成以后也可以凭自愿回天机宫，不一定非要在朝中任职，相当于只是去太学“留学”一次，这就不是只是挖人，还要明目张胆了渗透了，不过话题是她自己提出来的，也只是能认了，反正可以用刚学会的石阵武学再培养一批亲信。
离开天机宫以后开始了善后工作，公羊羽在福星道院出家为全真北宗道士，道号“六无”，册封为“福星八子”之一，享有同等的武功和药酒待遇。以公羊羽的声望，消息传出又引起了一阵震动。
安排从天机宫带出来的人在太学入学，开太学女科，从尚书内省选了五个女官担任教师。作为第一个主动投靠朝廷的天机宫弟子，给了明三秋一瓶五宝花蜜酒