其他二十八个弟子听了完颜萍对药酒功效的介绍，又看到王翠翘喝下后确实没有什么不良反应，都忍着恐惧和不适，纷纷把药酒都喝了下去。等众弟子稳定了心神，三人开始传授他们内功，只有王翠翘被完颜萍带去了别处，她修习的内功和别人版本不同，需要单独传授。
这些弟子的身体都是经过强化的，在三人的指导下，所有弟子分别修炼减配版《道家心法》、《九阳玄功》、《玉女葵花经》一天就入了门，炼化了药酒，并且运功行遍了全身经脉几个大周天，之后就可以随时随地都被动无意识运转增长功力了。
二十九个弟子修炼内功入了门，以后内力就能随着时间流逝不断增长了，等内力积累深厚到一定程度，修炼外功招式就是非常容易的。郭靖只是在马钰指导下修炼了两年全真派基础内功，出招的速度和精度都大增，何况弟子们修炼的内功远胜马钰传授郭靖的。
之后就正式对所有弟子开始了内家拳基础训练，从站桩开始，马步、三体式、走抹油水缸泥步，逐渐深入，内家拳基础阶段每一天都要有师父指导，纠正每一个动作，务求绝对规范。
基础阶段一般需要一年，这就是唐紫尘训练王超的时间，沈飞三人当然要大大缩短这个时间，除了强筋壮骨丹和虎豹雷音强化筋骨以外，还有其他的措施。
这一阶段训练极其严格，所有人每天练功、抄拳谱、军事著作的时间都在二十个小时左右，摔倒了运功点穴给他们舒缓止痛，再以针灸提高他们的睡眠质量，加内功打坐，第二天马就是精神饱满。
而且对所有弟子的饮食不惜工本，选择以前给客栈供货商里最顶级的一批食材，每天都由沈飞、完颜萍和杨灵月之一亲自下厨，按照医理制作最好的食疗。
马房里二十九匹马，每天也由三人之一进行照料，骑术训练当然也包括养马在内，不过这段时间是弟子们的基础训练时间，他们最重要的任务就是专心练功，不管别的事情。连本来值日轮流打扫都取消了，由沈飞三人接手。
这段时间休息最少的反而是沈飞三个人，不过只要打坐半个小时就足够精神饱满了。弟子们除了练功辛苦，其实是沈飞三人在全力照顾他们的衣食住行，甚至说白了是在侍候他们。有几个弟子感觉到不安，尤其是王翠翘已经提出来好几次了，沈飞三人只是让他们专心练功，不要理会其他事情，尽快度过基础训练阶段。
足足超强训练了四个月时间，经过无数次摔打，形意、八卦、太极、八极、心意把、峨嵋先天拳、通臂缠拳、三皇炮捶、岳氏散手、太祖长拳、少林看家拳，所有掌握的内家拳的基础拳架子都传授给了弟子们，算是过了最初训练阶段，弟子们也都达到了明劲阶段。
之后才开始减少强度，让他们自由练习，同时增加了与习武有关的《易》学、医理等文化项目的学习，同时也恢复了打扫、养马和下厨的值日，每天分出一个人传授他们厨艺和配制营养餐，花一个月时间把厨房也全部交给弟子们，三人的休息和自由时间也大增。
沈飞三人也开始出门置办一些工具，发射暗器的围棋、使出音波功的瑶琴、铁箫。练习八卦掌磨盘大摔碑手的磨盘，练习太极的铅汞大球（当然是从空间里取出来的）都搬进来十几个，足够弟子们轮流使用。
又找来两套冶炼工具，一套前坩埚时代冶炼巅峰苏钢，这时候已经发明，可是没有普及。另一套就是坩埚准备冶炼高锰钢，现代统计山东铁矿石五千多吨，锰矿石更多，万吨，容易找地很，就是一些简单的从各种植物中能提取集齐的天然淬火溶夜也能配制出来。
虽然自己的空间里各种冷兵器很多，不过沈飞是想把冶炼方法都传授给弟子们，还是亲自动手。还采购了一些制作柄的木材、制作弓弦的牛筋、牛皮等一系列打造兵器需要的材料，至少要够每个弟子都学会制作各种兵器，以后动用空间里的储备也无所谓。
沈飞还第一次去了和嘉靖约定的秘密联络点，是一处杂货铺。当然是改变了身形容貌，并且用枯禅心法使外形老了四十多年。对了暗语，验过了腰牌后，对方请沈飞到了后堂，恭敬地询问沈飞有什么需要，他能办的一定满足，不能做主的也会报。
沈飞假称是奉师父之命前来，目前只有一个要求：就是想看官方邸报，以便了解变革动向。对方表示会报，等编写的邸报送到了，会在店铺外面贴到货的告示，就可以过来取。沈飞说的邸报，自然不是官府一般的流水帐，是有关各种变革进展的汇总，这恐怕是需要嘉靖点头，由专门的工作组编写的。
又过了两个月，弟子们内家拳水平达到了明劲巅峰，仅凭内家拳修为也足以与江湖大派第二代弟子一战了，第一批兵器已经自制完成，所有弟子都在指点下掌握了冶炼苏钢和高锰钢的技艺，开始兼修各种兵器，当然都只是内家拳系的。《易》理也初步掌握，云雁禹步也成了日常必修项目之一。
沈飞去联络点看见到货的标记，让完颜萍易容过去取回了变革汇编邸报，里面还有嘉靖的一封信，说他修炼功法大有进展，已经整理旧档为名暗中找出了当年郑和下西洋的档案，知道了确实有巨额利润。嘉靖果然成立